Управление МБОУ г.Керчи РК «Школа №2» осуществляется в соответствии с нормативными правовыми актами Российской Федерации, Республики Крым, правовыми актами Керченского городского совета Республики Крым и Администрации города Керчи Республики Крым, а также Уставом школы. Управление осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.

Директор назначается Учредителем, а заместители – директором по согласованию с Учредителем.

Заместитель директора по УВР - Сорочан Лариса Валерьевна

Заместитель директора по УВР - Лейман Елена Борисовна

Заместитель директора по ВР – Снисарь Виктория Витальевна

Заместитель директора по АХЧ - Ковбасюк Петр Васильевич

Методический совет - профессиональный общественный орган, объединяющий на добровольной основе членов педагогического коллектива образовательного учреждения в целях осуществления руководства методической деятельностью. Он координирует работу подструктур методической службы, направленную на развитие научно-методического обеспечения образовательного процесса, инноваций, опытно-экспериментальной и научно-исследовательской деятельности педагогического коллектива.